domingo, 12 de diciembre de 2021

Los bloques de construcción de la biología

 Todo en biología puede reducirse a átomos individuales. Averiguar cómo estos átomos forman moléculas, cómo interactúan entre sí y qué significa esto para los organismos biológicos es el enfoque del trabajo de la Dra. Angela Gronenborn en la Universidad de Pittsburgh.
DRA ANGELA M GRONENBORN
UPMC Rosalind Franklin Cátedra y Profesora Distinguida, Departamento de Biología Estructural, Universidad de Pittsburgh, EE.UU.
Nacional de Ciencias de los Institutos Nacionales de Salud

https://doi.org/10.33424/FUTURUM79


Asistiendo a la Marcha por la Ciencia, 2017, en Washington DC.

La Dra. Angela Gronenborn pronunciando una conferencia.

El hijo de Naima, Julius, visitando el laboratorio y jugando con un modelo de proteína.

Angela en la reunión de asBMB (Sociedad Americana de Bioquímica y Biología Molecular) 2019 con su colega, Lila Gierasch.

Angela y su hermano, Bruno Gronenborn, haciendo senderismo en los Alpes italianos.

La biología estructural es el estudio de la estructura molecular y las interacciones de las macromoléculas biológicas. En particular, se centra en las proteínas y los ácidos nucleicos, que son responsables de la mayoría de las funciones complejas y fundamentales dentro de las células. Es un campo que incorpora aspectos de la biología molecular, la bioquímica y la biofísica.
"Todoos días hay un nuevo rompecabezas", dice

Descubrir las interacciones moleculares que gobiernan las células

 biológicas no es sencillo. Hay una serie de técnicas que los 

biólogos estructurales utilizan para averiguar qué está pasando a 

nivel molecular.

 Piense en la analogía del elefante y las personas con los 

ojos vendados: cada persona puede sentir una parte del elefante: 

su trompa, su pata, etc. pero solo comunicándose entre sí 

pueden tener una idea de cómo se

 ve toda la criatura. Es lo mismo en biología estructural: solo

 a través de

 diferentes equipos de investigadores, utilizando diferentes

 técnicas y 

colaborando, pueden tener una idea del panorama general y

 tener 

un impacto efectivo y positivo en el mundo.

ESPECTROSCOPIA DE RMN

Angela Gronenborn es una defensora de la espectroscopia de 

resonancia 

magnética nuclear (RMN), una técnica utilizada para averiguar 

la estructura

 de las proteínas y otras moléculas. En primer lugar, la molécula

 objetivo 

se crea con ciertos isótopos dentro de su estructura. Cada isótopo

 tiene 

su propia identidad magnética y vibrará a una cierta frecuencia 

cuando 

se expone a un campo magnético. La RMN consiste en colocar 

estas 

muestras dentro de un campo magnético fuerte y registrar los

patrones

 de excitación que emiten los isótopos involucrados. Estas 

"frecuencias 

de resonancia" se registran y utilizan para identificar la estructura 

de la molécula. Una vez que se recopila esta información,

se somete 

a un análisis complejo utilizando sofisticadas herramientas 

computacionales. El producto final es un modelo tridimensional

 que se puede visualizar y explorar en una pantalla de computadora.

ISÓTOPOS Y FLÚOR

Los isótopos se forman cuando un átomo tiene un número diferente 

de 

neutrones a protones, una propiedad que les da una firma única 

sin

 dejar de conservar todas las propiedades químicas normales del

 elemento. Una forma común de obtener isótopos en la molécula 

objetivo es cultivar bacterias en nutrientes ricos en isótopos para 

que se incorporen a sus biomoléculas, que luego se extraen. 

Los isótopos comunes utilizados en la RMN incluyen deuterio 

(hidrógeno-2), carbono-13 y nitrógeno-15, porque estos son

 isótopos 

accesibles de los elementos que son más comunes dentro de los 

organismos.

Sin embargo, la investigación de Angela utiliza flúor-19 en lugar de 

los

 isótopos más convencionales. 

El flúor no se encuentra naturalmente

 dentro de las biomoléculas. "El objetivo general de este programa 

de investigación es establecer la espectroscopia de RMN de

 flúor-19

 como un enfoque versátil para describir la estructura y la

geometría

 de las proteínas", dice. La principal ventaja de usar flúor es que 

rara

 vez sufre de interferencia de fondo. Debido a que los isótopos de 

hidrógeno, carbono y nitrógeno se encuentran comúnmente en la 

naturaleza, a menudo aparecen en la RMN incluso cuando no son 

parte de la molécula objetivo. Agregar flúor-19 a una molécula 

significa que, si su frecuencia de resonancia aparece en el análisis, 

es casi seguro que está dentro de la molécula objetivo. 

Sin embargo, 

debido a que no es una parte natural de la mayoría de la biología, 

los investigadores deben estar atentos al agregarlo a las moléculas.

 "Cada proteína se comporta de manera diferente y siempre tenemos

 que asegurarnos de que el patrón de plegamiento de la molécula o

 su estabilidad no se vea influenciado".

APLICACIONES DEL MUNDO REAL

"El proyecto implica una integración de enfoques computacionales

 y 

experimentales", dice Angela. "También planeamos integrar la

 formación

 científica con las humanidades, para ayudar a preparar a 

los 

estudiantes para comunicar la ciencia al público". El equipo 

espera 

demostrar la utilidad de la RMN con flúor como una técnica para 

descubrir información importante que otras técnicas no pueden. 

El equipo de Angela ya ha logrado avances en el uso de la RMN

 con flúor para descifrar proteínas y pequeñas moléculas 

farmacéuticas. Esto tiene algunas aplicaciones prácticas

 importantes. 

"Usaremos la RMN con flúor para realizar exámenes de detección 

de drogas, lo que debería ser muy útil para el diseño de 

medicamentos",

 dice. Angela espera utilizar la técnica en células vivas, para 

poder ver lo 

que las proteínas están haciendo en tiempo real. El equipo también 

ha encontrado algunos efectos inesperados, en particular con 

respecto a las propiedades de fluorescencia de las moléculas, 

en otras

 palabras, la radiación que emiten. "Siempre hay sorpresas", 

dice Angela. "Eso es lo bueno de la ciencia: siempre hay un nuevo

 rompecabezas que resolver".

HABLA COMO UN BIÓLOGO ESTRUCTURAL

FLÚOR: Un elemento relativamente ligero que viene después del

 oxígeno en la tabla periódica. A menudo no está presente de 

forma natural en los organismos, particularmente en los animales.

ISÓTOPO: Variedad de un elemento que tiene un número diferente

 de neutrones a protones. Pueden escribirse como (por ejemplo)

carbono-13 o 13C, donde el número se refiere a la suma de los 

protones y neutrones del elemento.

MACROMOLÉCULA: Molécula que contiene un gran número de

 átomos, como una proteína o ácido nucleico.

Tipo de espectroscopia que consiste en poner moléculas en 

un campo magnético y registrar la señal producida por la 

excitación de la muestra.

ÁCIDO NUCLEICO: Las biomoléculas que componen el código 

genético de los organismos, es decir, el ADN.

PROTEÍNA: Una biomolécula hecha de aminoácidos, que están 

codificados por ácidos nucleicos.

ESPECTROSCOPIA: Técnica que consiste en estudiar la 

interacción de moléculas y radiación electromagnética

 (por ejemplo, ondas de radio).

CAMPO DE INVESTIGACIÓN: Biología Estructural

PROYECTO DE INVESTIGACIÓN: Investigar las 

aplicaciones de la espectroscopia de RMN flúor como

 técnica para la comprensión de la biología estructural.

FINANCIADOR: Fundación

ACERCA DE LA BIOLOGÍA ESTRUCTURAL

¿QUÉ ES LA BIOLOGÍA ESTRUCTURAL?

PREGUNTÉMOSLE A ÁNGELA:

¿QUÉ ES LO QUE ENCUENTRAS MÁS GRATIFICANTE DE TU T

RABAJO?

Angela. "No hay dos problemas iguales y cada vez se trata de trabajar 

progresivamente hacia la explicación más probable. Esto implica mucha 

deducción: probar todas las explicaciones posibles y descartarlas si 

no se sostienen, hasta que te encuentres con la que tiene más 

probabilidades de ser cierta".

¿QUÉ CUALIDAD PERSONAL ENCUENTRAS MÁS ÚTIL PARA TU 

INVESTIGACIÓN?

"Tengo mucha suerte de tener una muy buena memoria visual", dice

Angela. "Entonces, una vez que he visto un modelo de proteína, sé 

cómo se ve. Mirar una proteína en una pantalla, darle la vuelta y 

seleccionar cada detalle, se arraiga en mi mente".

¿POR QUÉ ES TAN IMPORTANTE UN ENFOQUE INTEGRADO Y 

COLABORATIVO?

"La naturaleza es compleja y la complejidad debe abordarse en su

 totalidad", dice

Angela. "Con cualquier método que utilicemos para ver un objeto, 

omitimos algunas de sus características y solo obtenemos una vista 

parcial. Necesitamos integrar muchos de estos puntos de vista para 

acercarnos a una comprensión más completa. Y, desde una

 perspectiva práctica, la colaboración me ayuda a hacer una mejor 

ciencia. No podemos ser expertos en todo, pero al combinar

 nuestras áreas de especialización, ¡podemos llegar a ser imbatibles!"

¿QUÉ PROYECTO A GRAN ESCALA TE GUSTARÍA QUE SE 

HICIERA REALIDAD?

"Como biólogos estructurales, nos encantaría tener una 'película' c

ompleta de una célula y ver cómo se ve afectada por la enfermedad 

y otros

factores. Luego podemos usar nuestra comprensión estructural para

 investigar las vías moleculares que han salido mal y elaborar soluciones. 

Eso sería fantástico".

¿CUÁL CREES QUE ES EL MAYOR DESAFÍO DE LA EDUCACIÓN 

CIENTÍFICA?

"Creo que todos los niños pequeños son naturalmente curiosos y 

podrían sentirse atraídos por la

ciencia. Desafortunadamente, "aprender haciendo" no es un enfoque 

común en las escuelas para enseñar ciencias, y esto puede significar

 que muchos no alcanzan la comprensión científica básica. 

Como científicos, tenemos que tratar constantemente de educar

 a quienes nos rodean".

CÓMO CONVERTIRSE EN BIÓLOGO 
ESTRUCTURAL

• La biología estructural rara vez es un curso de pregrado en sí mismo,

 pero sus primos cercanos, la biología molecular y la bioquímica, 

a veces lo son. El material relevante a menudo también se cubre 

dentro de cursos más amplios de biología y química.

• Según UK News, las mejores universidades del Reino Unido para 

cursos que involucran biología molecular y genética son Cambridge, 

Oxford, University College London, Edimburgo e Imperial College

 London.

• Según US News, las mejores universidades estadounidenses para 

cursos de biología molecular y genética son Harvard, MIT,

Stanford, California (San Francisco) y John Hopkins.

• Según Payscale.com, el salario promedio de un biólogo molecular 

es de $ 59k.

CAMINO DE LA ESCUELA AL BIÓLOGO 

ESTRUCTURAL

Angela recomienda tomar matemáticas, física y química en la escuela.

 La biología también puede ser útil, pero no siempre es esencial: 

Angela no tiene antecedentes biológicos.

 También aconseja buscar una educación completa, 

con literatura e idiomas si es posible.

En la universidad, cursos como bioquímica, biología molecular

 biomedicina y otros temas similares pueden conducir a una

 carrera en biología estructural.

¿CÓMO SE CONVIRTIÓ LA DRA.

 ANGELA GRONENBORN EN BIÓLOGA 

ESTRUCTURAL?

¿DE DÓNDE VIENE TU PASIÓN POR LA CIENCIA?

No estoy exactamente seguro. En la escuela, estaba convencida de

 que iba a ser matemática, pero el director y mi padre me advirtieron 

que sería una carrera difícil como mujer. Entonces, decidí que 

estudiaría física y química. La verdadera emoción vino durante mi 

doctorado cuando fui expuesto al nuevo campo de la biología

 molecular por mi hermano biólogo. 

Decidí que finalmente usaría mi entrenamiento en RMN

 para estudiar sistemas biológicos, lo cual era imposible en ese momento.

¿CÓMO SUPERAS LOS OBSTÁCULOS EN TU TRABAJO?

Soy muy terco y obstinado. Lo intentaré de nuevo, incluso si algo 

parece casi imposible. Me obsesiono con un problema y no puedo 

dejarlo ir.

¿QUÉ TE GUSTA HACER FUERA DEL TRABAJO?

No necesito desconectarme, porque no veo la investigación como un t

TRabajo. ¡Soy muy afortunado de que me paguen por hacer mi pasatiempo! 

Hay muy pocas profesiones en las que uno tiene tal privilegio, artistas tal

 vez, pero en comparación con los artistas, nos pagan realmente. 

Sin embargo, disfruto del arte y la música, y dondequiera que viaje

 para dar conferencias, hago tiempo para visitar un museo.

¿CUÁLES SON TUS OBJETIVOS PARA EL FUTURO?

Espero poder ayudar a mis estudiantes a lograr lo que quieren lograr.

 He tenido mucha suerte en mi carrera y quiero empoderar a esos

aparendices dentro de mi esfera de influencia para que encuentren 

su propia suerte.

https://futurumcareers.com/the-building-blocks-of-biology

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